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SECUENCIACIÓN EXÓMICA COMPLETA TRIO + ESTUDIO DE VARIACIÓN EN EL NÚMERO DE COPIAS (HASTA 21000 GENES)
Código SOAD: 502078
Código OPC: 1007501

Utilidad clínica

En pacientes con alta heterogeneidad clínica (gran constelación de signos y síntomas) y con alta heterogeneidad molecular (muchos genes involucrados, con varios mecanismos de herencia y fisiopatológicos), ordenar una prueba genética puede ser un reto ya que existen en la actualidad varias metodologías a emplear en el marco de un ejercicio clínico de diagnóstico, el cual debe ser costo efectivo. Además, un diagnóstico tardío puede tener un impacto significativo en la calidad de vida del paciente.

La mayoría de las mutaciones causantes de enfermedades son puntuales y han sido identificadas hasta ahora en los exones. También se han descrito alteraciones de tipo deleciones y duplicaciones (re-arreglos) que pueden comprometer desde varios exones hasta uno o varios genes contiguos. Mientras que la mayor parte de las pruebas genéticas se centra en un gen único o un conjunto de genes predeterminados, la prueba de secuenciación del exoma completo examina miles de genes simultáneamente y también puede analizar la presencia de re-arreglos genómicos (CNVs)

Por esta razón esta prueba ofrece una solución rápida y costo-efectiva de un solo paso que consiste en la secuenciación de todos los exones a través del genoma.

Este estudio es recomendado para pacientes con:

Fenotipos heterogéneos, Discapacidad intelectual/retraso del desarrollo, Cardiomiopatías, Epilepsia, Distrofia / miopatías Musculares, Ataxias, Retinitis Pigmentosa, Trastornos óseos y del tejido conectivo, Trastornos metabólicos no diagnosticado, Tallas bajas idiopáticas, Trastornos dismórficos complejos, Inmunodeficiencias

Esta prueba entrega resultados claros de las variantes identificadas atendiendo las guías internacionales de mejores prácticas (Council of Medical Specialty Societies, American College of Medical Genetics)

Muestra

Tipo de muestra

Sangre Total con EDTA: 10 mL

Nota  : Para estas pruebas se toman muestras al Padre, a la madre y al hijo (paciente), el ingreso se hace a nombre del paciente (hijo) por ende todos los stickers salen con el código SOAD, nombre e identificación del paciente (hijo).

Con el fin de evitar errores en el marcaje inicial de las muestras y siguiendo los lineamientos de seguridad del paciente, se solicita que, para las muestras del Padre y la Madre, adicional al sticker del paciente (hijo) se les ponga a los tubos la siguiente información sin tapar el nombre del paciente:

  • Nombre Madre/Padre
  • ID Madre/Padre
  • Numero ingreso SOAD
  • Fecha

Estabilidad

Refrigerado 2-8°C : 5 Días

Logística

Días de proceso

Lunes a Viernes

Tiempo de informe

60 Días Hábiles

Técnica

Next Generation Sequencing (NGS)+ Cribado de número de copias CNVS.

Características técnicas

  • La metodología utilizada se basa en la captura de regiones diana de las zonas exónicas y secuenciación por NGS en plataformas lllumina que cubre la secuenciación de todo el exoma (WES ~ 21.000 genes), incluyendo las zonas de splicing codificantes.
  • En el informe clínico de resultados reporta tanto las variantes patogénicas/ probablemente patogénicas como las variantes de significado incierto (VUS). Incluye validaciones por métodos ortólogos de las variantes puntuales y si es el caso se recomienda otros estudios o validaciones adicionales para llegar a un diagnóstico completo.
  • Se ofrece la opción de incluir en el informe clínico el análisis de los genes accionables listados por el American College of Medical Genetics (ACMG) si el paciente así lo solicita.

Condición del Paciente

No requiere ayuno.

Para la toma de muestra es INDISPENSABLE la asistencia de ambos padres y el paciente.

Diligenciar Formatos:Consentimiento informado para Estudio de pruebas genéticas F-CCO009 Y consentimiento de estudios de investigación F-CCO11

Descargar el archivo Pasos de toma mde muestra y explicarlo al momento de la toma de la muestra

Observaciones

  • Anexar Datos Clínicos y/o Resumen de Historia Clínica.
  • Consultar Instructivo Instrucciones extracción de muestra.
  • Se deben diligenciar todos los apartados de  el consentimiento, en especial los datos demográficos del paciente y las firmas.
  • NOTA: Derivado a la complejidad de las pruebas el tiempo de oportunidad puede verse afectado incluso 30 días hábiles más según el caso y la historia clínica del paciente
  • , Comunicarse con servicio al cliente cerca del cumplimiento de oportunidad para verificar el tiempo de salida

Ver Anexo.

Nota: Para la realizacion de esta prueba, se debe diligenciar un consentimiento informado independiente para la madre, otro para el padre y otro para el hijo. Adicional los padres deberán asentir en el consentimiento informado del hijo en caso de ser menor de edad.